Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxd12P23812 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd12P23812 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms