Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PparaP23204 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PparaP23204 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PparaP23204 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PparaP23204 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms