Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RarbP22605 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RarbP22605 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RarbP22605 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms