Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clk1P22518 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms