Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou3f1P21952 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms