Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpm3P21107 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpm3P21107 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms