Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ntf3P20181 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms