Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a1P19437 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a1P19437 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms