Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifrd1P19182 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms