Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms