Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rps6ka1P18653 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6ka1P18653 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms