Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P18533 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18533 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18533 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18533 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms