Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P18530 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P18530 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P18530 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P18530 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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