Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpraP18052 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpraP18052 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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