Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxb1P17919 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxb1P17919 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms