Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa-rs1P17533 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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