Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChgbP16014 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChgbP16014 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChgbP16014 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms