Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rag1P15919 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms