Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prph2P15499 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prph2P15499 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prph2P15499 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prph2P15499 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prph2P15499 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prph2P15499 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms