Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irf1P15314 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Irf1P15314 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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