Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-D1P14427 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-D1P14427 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms