Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Vpreb2P13373 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms