Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Calb1P12658 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Calb1P12658 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms