Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timp1P12032 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms