Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lamp1P11438 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lamp1P11438 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms