Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PolP11369 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PolP11369 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PolP11369 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PolP11369 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PolP11369 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PolP11369 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PolP11369 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PolP11369 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms