Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nid1P10493 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nid1P10493 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms