Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lynx1P0DP60 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms