Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Calm3P0DP28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Calm3P0DP28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms