Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itgb1P09055 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itgb1P09055 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms