Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NefmP08553 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NefmP08553 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NefmP08553 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NefmP08553 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NefmP08553 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms