Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApoeP08226 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms