Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a2P08122 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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