Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Egr1P08046 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms