Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa4P06798 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms