Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-Eb1P04230 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-Eb1P04230 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms