Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgfb1P04202 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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