Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt1P04104 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt1P04104 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt1P04104 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krt1P04104 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms