Protein–RNA interactions for Protein: P03976

Ig kappa chain V-II region 17S29.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03976 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P03976 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P03976 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P03976 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P03976 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P03976 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P03976 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P03976 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P03976 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P03976 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P03976 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P03976 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms