Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtnd1P03888 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms