Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lamc1P02468 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lamc1P02468 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms