Protein–RNA interactions for Protein: P01677

Ig kappa chain V-VI region TEPC 601/TEPC 191, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01677 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01677 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01677 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01677 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01677 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01677 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms