Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01672 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01672 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01672 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01672 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01672 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01672 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01672 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01672 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01672 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01672 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01672 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms