Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01669 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01669 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01669 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P01669 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01669 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01669 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01669 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01669 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01669 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01669 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01669 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01669 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01669 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms