Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01652 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01652 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P01652 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P01652 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P01652 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P01652 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
P01652 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
P01652 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01652 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01652 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01652 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01652 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01652 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms