Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifnb1P01575 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifnb1P01575 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms