Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lancl1O89112 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lancl1O89112 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lancl1O89112 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lancl1O89112 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lancl1O89112 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lancl1O89112 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms