Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcn2O88968 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms