Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apaf1O88879 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apaf1O88879 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apaf1O88879 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apaf1O88879 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apaf1O88879 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apaf1O88879 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apaf1O88879 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms