Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ShdO88834 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ShdO88834 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ShdO88834 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ShdO88834 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ShdO88834 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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